Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VAPAQ9P0L0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAPAQ9P0L0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms