Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MSRB1Q9NZV6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MSRB1Q9NZV6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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