Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ARHGEF12Q9NZN5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF12Q9NZN5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF12Q9NZN5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms