Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM53CQ9NYF3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms