Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPP4R2Q9NY27 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPP4R2Q9NY27 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPP4R2Q9NY27 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPP4R2Q9NY27 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPP4R2Q9NY27 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPP4R2Q9NY27 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPP4R2Q9NY27 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PPP4R2Q9NY27 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPP4R2Q9NY27 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PPP4R2Q9NY27 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms