Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ING3Q9NXR8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms