Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDE1Q9NXR1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NDE1Q9NXR1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms