Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MS4A12Q9NXJ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MS4A12Q9NXJ0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A12Q9NXJ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms