Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
THUMPD1Q9NXG2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THUMPD1Q9NXG2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
THUMPD1Q9NXG2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
THUMPD1Q9NXG2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD1Q9NXG2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD1Q9NXG2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD1Q9NXG2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THUMPD1Q9NXG2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD1Q9NXG2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD1Q9NXG2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD1Q9NXG2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD1Q9NXG2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD1Q9NXG2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD1Q9NXG2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD1Q9NXG2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD1Q9NXG2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD1Q9NXG2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THUMPD1Q9NXG2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms