Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB20Q9NX57 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB20Q9NX57 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms