Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW0

HCFC1R1, Host cell factor C1 regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1R1Q9NWW0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HCFC1R1Q9NWW0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HCFC1R1Q9NWW0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCFC1R1Q9NWW0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms