Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ASF1BQ9NVP2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ASF1BQ9NVP2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms