Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARVAQ9NVD7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARVAQ9NVD7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms