Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM140Q9NV12 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM140Q9NV12 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM140Q9NV12 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms