Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPTLC3Q9NUV7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPTLC3Q9NUV7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms