Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUK0

MBNL3, Muscleblind-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL3Q9NUK0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MBNL3Q9NUK0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBNL3Q9NUK0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms