Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCND1Q9NSA2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCND1Q9NSA2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms