Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD18Q9NS91 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD18Q9NS91 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD18Q9NS91 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms