Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPRSS4Q9NRS4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMPRSS4Q9NRS4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms