Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA1

PDGFC, Platelet-derived growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFCQ9NRA1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFCQ9NRA1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFCQ9NRA1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFCQ9NRA1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFCQ9NRA1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFCQ9NRA1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFCQ9NRA1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFCQ9NRA1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFCQ9NRA1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDGFCQ9NRA1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFCQ9NRA1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFCQ9NRA1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFCQ9NRA1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PDGFCQ9NRA1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFCQ9NRA1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFCQ9NRA1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDGFCQ9NRA1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms