Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C8orf4Q9NR00 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf4Q9NR00 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.33■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms