Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM8Q9NQV8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRDM8Q9NQV8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.6 ms