Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INCENPQ9NQS7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
INCENPQ9NQS7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
INCENPQ9NQS7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INCENPQ9NQS7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
INCENPQ9NQS7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INCENPQ9NQS7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INCENPQ9NQS7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
INCENPQ9NQS7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
INCENPQ9NQS7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
INCENPQ9NQS7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INCENPQ9NQS7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms