Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A3Q9NQ40 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC52A3Q9NQ40 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms