Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP13A2Q9NQ11 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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