Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD93Q9NPY3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD93Q9NPY3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms