Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MID1IP1Q9NPA3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms