Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGAP3Q9NP61 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARFGAP3Q9NP61 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms