Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
XAB2Q9HCS7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XAB2Q9HCS7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XAB2Q9HCS7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms