Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARVBQ9HBI1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVBQ9HBI1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms