Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LY9Q9HBG7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LY9Q9HBG7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms