Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UPF2Q9HAU5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UPF2Q9HAU5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms