Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN28AQ9H9Z2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN28AQ9H9Z2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms