Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C10orf88Q9H8K7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms