Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRKRIP1Q9H875 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PRKRIP1Q9H875 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PRKRIP1Q9H875 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms