Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TDRD3Q9H7E2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TDRD3Q9H7E2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TDRD3Q9H7E2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms