Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B9

EPHX3, Epoxide hydrolase 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHX3Q9H6B9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHX3Q9H6B9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPHX3Q9H6B9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPHX3Q9H6B9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHX3Q9H6B9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHX3Q9H6B9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHX3Q9H6B9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHX3Q9H6B9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHX3Q9H6B9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHX3Q9H6B9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHX3Q9H6B9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHX3Q9H6B9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms