Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SMARCAD1Q9H4L7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCAD1Q9H4L7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCAD1Q9H4L7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCAD1Q9H4L7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCAD1Q9H4L7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCAD1Q9H4L7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCAD1Q9H4L7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCAD1Q9H4L7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMARCAD1Q9H4L7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCAD1Q9H4L7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCAD1Q9H4L7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCAD1Q9H4L7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCAD1Q9H4L7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCAD1Q9H4L7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMARCAD1Q9H4L7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCAD1Q9H4L7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMARCAD1Q9H4L7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms