Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC8Q9H0W5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC8Q9H0W5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC8Q9H0W5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC8Q9H0W5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC8Q9H0W5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC8Q9H0W5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC8Q9H0W5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC8Q9H0W5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC8Q9H0W5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC8Q9H0W5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms