Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LSG1Q9H089 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LSG1Q9H089 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms