Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZW8

MS4A7, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A7Q9GZW8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
MS4A7Q9GZW8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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MS4A7Q9GZW8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MS4A7Q9GZW8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms