Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C20orf27Q9GZN8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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C20orf27Q9GZN8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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C20orf27Q9GZN8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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C20orf27Q9GZN8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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