Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SEMA4CQ9C0C4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA4CQ9C0C4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4CQ9C0C4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms