Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMES1Q9C002 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms