Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOXP3Q9BZS1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms