Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP3Q9BZ76 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP3Q9BZ76 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP3Q9BZ76 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms