Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PARD6BQ9BYG5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms