Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL1Q9BYD6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL1Q9BYD6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms