Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY19

MS4A8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A8Q9BY19 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A8Q9BY19 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A8Q9BY19 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms