Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD1Q9BXT4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD1Q9BXT4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms